MKVtoolnix è un software che consente di editare i file MKV (Matroska), un contenitore multimediale in grado di includere altri formati codificati con i codec più diffusi. Il programma permette di visualizzare il contenuto del file MKV, creare nuovi flussi audio e video, estrarre le varie tracce o dividere i filmati Matroska in più file di piccole dimensioni.