X-Setup permette di modificare centinaia di impostazioni nascoste per Windows. L'interfaccia utente è strutturata ad albero, per rendere semplice l'accesso a tutte le categorie (Aspetto, Componenti Hardware, Informazioni, Internet, Rete, Opzioni dei programmi, Programmi, Avvio e Chiusura, Sistema). Vi è pure una modalità wizard in grado di aiutare l'utente a modificare passo passo le impostazioni desiderate.