Winsonar 2003 è un programma specificatamente progettato per tenere sotto controllo i programmi che funzionano in backgroung; oltre a rilevare i programmi che partono al boot, rileva i programmi che partono in backgroung in modo silenzionso ( alcuni partono solo al momento della conessione ), permettendo di identificare i file responsabili dell'avvio di questi programmi ( es. spyware o virus ).